Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D1P51668 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D1P51668 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms