Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
SMARCA2P51531 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
SMARCA2P51531 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
SMARCA2P51531 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms