Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB28P51157 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB28P51157 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB28P51157 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB28P51157 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB28P51157 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB28P51157 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB28P51157 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB28P51157 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB28P51157 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB28P51157 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB28P51157 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB28P51157 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB28P51157 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB28P51157 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB28P51157 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB28P51157 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB28P51157 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB28P51157 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB28P51157 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB28P51157 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB28P51157 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB28P51157 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB28P51157 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB28P51157 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB28P51157 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB28P51157 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB28P51157 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB28P51157 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234 ms