Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK7P50613 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK7P50613 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK7P50613 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK7P50613 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK7P50613 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK7P50613 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK7P50613 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK7P50613 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK7P50613 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK7P50613 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK7P50613 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK7P50613 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK7P50613 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK7P50613 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK7P50613 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK7P50613 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK7P50613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK7P50613 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK7P50613 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK7P50613 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK7P50613 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK7P50613 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK7P50613 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK7P50613 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK7P50613 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK7P50613 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK7P50613 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK7P50613 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK7P50613 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK7P50613 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK7P50613 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK7P50613 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK7P50613 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK7P50613 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK7P50613 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK7P50613 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK7P50613 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK7P50613 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK7P50613 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK7P50613 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK7P50613 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK7P50613 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK7P50613 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK7P50613 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK7P50613 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK7P50613 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK7P50613 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK7P50613 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK7P50613 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK7P50613 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK7P50613 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK7P50613 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK7P50613 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK7P50613 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK7P50613 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK7P50613 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK7P50613 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms