Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFSF10P50591 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF10P50591 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms