Protein–RNA interactions for Protein: P50453

SERPINB9, Serpin B9, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB9P50453 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERPINB9P50453 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINB9P50453 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINB9P50453 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms