Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RARRES1P49788 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RARRES1P49788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms