Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN1P49768 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN1P49768 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms