Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPIAP49247 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPIAP49247 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPIAP49247 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPIAP49247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPIAP49247 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPIAP49247 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPIAP49247 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPIAP49247 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPIAP49247 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPIAP49247 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPIAP49247 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPIAP49247 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPIAP49247 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPIAP49247 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPIAP49247 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPIAP49247 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPIAP49247 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPIAP49247 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPIAP49247 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPIAP49247 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPIAP49247 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPIAP49247 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPIAP49247 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPIAP49247 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPIAP49247 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPIAP49247 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPIAP49247 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPIAP49247 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPIAP49247 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPIAP49247 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPIAP49247 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPIAP49247 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPIAP49247 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPIAP49247 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPIAP49247 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPIAP49247 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPIAP49247 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPIAP49247 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPIAP49247 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPIAP49247 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPIAP49247 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPIAP49247 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPIAP49247 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPIAP49247 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPIAP49247 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPIAP49247 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPIAP49247 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPIAP49247 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPIAP49247 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPIAP49247 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPIAP49247 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPIAP49247 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPIAP49247 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms