Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP5P45974 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP5P45974 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP5P45974 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP5P45974 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP5P45974 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP5P45974 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP5P45974 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP5P45974 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP5P45974 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP5P45974 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP5P45974 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP5P45974 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP5P45974 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP5P45974 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP5P45974 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP5P45974 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP5P45974 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP5P45974 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP5P45974 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP5P45974 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP5P45974 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP5P45974 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP5P45974 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP5P45974 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP5P45974 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP5P45974 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP5P45974 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP5P45974 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP5P45974 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP5P45974 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP5P45974 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP5P45974 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP5P45974 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP5P45974 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP5P45974 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP5P45974 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP5P45974 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP5P45974 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP5P45974 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP5P45974 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP5P45974 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP5P45974 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP5P45974 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP5P45974 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP5P45974 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP5P45974 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP5P45974 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP5P45974 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP5P45974 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP5P45974 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP5P45974 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP5P45974 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP5P45974 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP5P45974 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP5P45974 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP5P45974 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP5P45974 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms