Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCAMP43121 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCAMP43121 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCAMP43121 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCAMP43121 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCAMP43121 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCAMP43121 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCAMP43121 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCAMP43121 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCAMP43121 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCAMP43121 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCAMP43121 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MCAMP43121 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCAMP43121 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCAMP43121 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCAMP43121 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCAMP43121 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCAMP43121 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCAMP43121 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCAMP43121 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCAMP43121 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MCAMP43121 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCAMP43121 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCAMP43121 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCAMP43121 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCAMP43121 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCAMP43121 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCAMP43121 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCAMP43121 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCAMP43121 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MCAMP43121 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCAMP43121 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCAMP43121 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCAMP43121 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MCAMP43121 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCAMP43121 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCAMP43121 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCAMP43121 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCAMP43121 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCAMP43121 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCAMP43121 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCAMP43121 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCAMP43121 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCAMP43121 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCAMP43121 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCAMP43121 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCAMP43121 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCAMP43121 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCAMP43121 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCAMP43121 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCAMP43121 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCAMP43121 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCAMP43121 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCAMP43121 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCAMP43121 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCAMP43121 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCAMP43121 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCAMP43121 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCAMP43121 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCAMP43121 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCAMP43121 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCAMP43121 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms