Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER3P43115 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER3P43115 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms