Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMPOP42166 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMPOP42166 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMPOP42166 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMPOP42166 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMPOP42166 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TMPOP42166 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMPOP42166 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TMPOP42166 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMPOP42166 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMPOP42166 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMPOP42166 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMPOP42166 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMPOP42166 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMPOP42166 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMPOP42166 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMPOP42166 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMPOP42166 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMPOP42166 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMPOP42166 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMPOP42166 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMPOP42166 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMPOP42166 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMPOP42166 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMPOP42166 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMPOP42166 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMPOP42166 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMPOP42166 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMPOP42166 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMPOP42166 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMPOP42166 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMPOP42166 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMPOP42166 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMPOP42166 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TMPOP42166 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMPOP42166 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMPOP42166 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMPOP42166 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMPOP42166 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMPOP42166 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMPOP42166 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMPOP42166 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMPOP42166 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMPOP42166 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMPOP42166 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMPOP42166 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMPOP42166 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMPOP42166 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMPOP42166 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMPOP42166 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMPOP42166 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMPOP42166 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMPOP42166 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TMPOP42166 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMPOP42166 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TMPOP42166 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMPOP42166 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMPOP42166 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMPOP42166 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMPOP42166 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMPOP42166 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TMPOP42166 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMPOP42166 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMPOP42166 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMPOP42166 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMPOP42166 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMPOP42166 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMPOP42166 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TMPOP42166 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMPOP42166 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMPOP42166 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMPOP42166 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMPOP42166 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMPOP42166 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMPOP42166 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMPOP42166 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms