Protein–RNA interactions for Protein: P38301

GDT1, GCR1-dependent translation factor 1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDT1P38301 YLH47YPR125W 1365 nt5.5□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YHR045WYHR045W 1683 nt5.5□□□□□ -1.53
GDT1P38301 TFC7YOR110W 1308 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 RPT1YKL145W 1404 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YFR035CYFR035C 345 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 PDE1YGL248W 1110 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 TFG2YGR005C 1203 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YKL107WYKL107W 930 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YNL228WYNL228W 777 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 GLT1YDL171C 6438 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 IMA1YGR287C 1770 nt5.49□□□□□ -1.53
GDT1P38301 HOS1YPR068C 1413 nt5.48□□□□□ -1.53
GDT1P38301 BRE2YLR015W 1518 nt5.48□□□□□ -1.53
GDT1P38301 GUS1YGL245W 2127 nt5.48□□□□□ -1.53
GDT1P38301 TAH18YPR048W 1872 nt5.48□□□□□ -1.53
GDT1P38301 PRP40YKL012W 1752 nt5.48□□□□□ -1.53
GDT1P38301 GEP3YOR205C 1671 nt5.48□□□□□ -1.53
GDT1P38301 RPL21BYPL079W 483 nt5.48□□□□□ -1.53
GDT1P38301 MNT2YGL257C 1677 nt5.47□□□□□ -1.53
GDT1P38301 AVO1YOL078W 3531 nt5.47□□□□□ -1.53
GDT1P38301 DFG5YMR238W 1377 nt5.47□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YNL194CYNL194C 906 nt5.47□□□□□ -1.53
GDT1P38301 GPM3YOL056W 912 nt5.47□□□□□ -1.53
GDT1P38301 YPR195CYPR195C 330 nt5.47□□□□□ -1.53
GDT1P38301 FOB1YDR110W 1701 nt5.47□□□□□ -1.53
GDT1P38301 PTR2YKR093W 1806 nt5.46□□□□□ -1.53
GDT1P38301 VID22YLR373C 2706 nt5.46□□□□□ -1.54
GDT1P38301 ASP1YDR321W 1146 nt5.46□□□□□ -1.54
GDT1P38301 ATG12YBR217W 561 nt5.46□□□□□ -1.54
GDT1P38301 YGR125WYGR125W 3111 nt5.45□□□□□ -1.54
GDT1P38301 NTH2YBR001C 2343 nt5.45□□□□□ -1.54
GDT1P38301 RMR1YGL250W 726 nt5.45□□□□□ -1.54
GDT1P38301 ELC1YPL046C 300 nt5.45□□□□□ -1.54
GDT1P38301 CDS1YBR029C 1374 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 CTS2YDR371W 1536 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 RPS16BYDL083C 432 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 YPT32YGL210W 669 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 MRP21YBL090W 534 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 NRM1YNR009W 750 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 QCR2YPR191W 1107 nt5.44□□□□□ -1.54
GDT1P38301 CDC19YAL038W 1503 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 SKS1YPL026C 1509 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 VHC1YBR235W 3363 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 UPS3YDR185C 540 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 PHM8YER037W 966 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 YAR061WYAR061W 204 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 AAD15YOL165C 432 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 MED4YOR174W 855 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 SIF2YBR103W 1608 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 PEX29YDR479C 1665 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 NOP2YNL061W 1857 nt5.43□□□□□ -1.54
GDT1P38301 NUP1YOR098C 3231 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 PRR1YKL116C 1557 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 HXT5YHR096C 1779 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 CKA2YOR061W 1020 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 ULA1YPL003W 1389 nt5.42□□□□□ -1.54
GDT1P38301 YEF1YEL041W 1488 nt5.41□□□□□ -1.54
GDT1P38301 SHM1YBR263W 1473 nt5.41□□□□□ -1.54
GDT1P38301 MTF1YMR228W 1026 nt5.41□□□□□ -1.54
GDT1P38301 SCS22YBL091C-A 528 nt5.4□□□□□ -1.54
GDT1P38301 ROX3YBL093C 663 nt5.4□□□□□ -1.54
GDT1P38301 HXT14YNL318C 1623 nt5.4□□□□□ -1.55
GDT1P38301 PGM2YMR105C 1710 nt5.4□□□□□ -1.55
GDT1P38301 COS10YNR075W 1125 nt5.39□□□□□ -1.55
GDT1P38301 CDC21YOR074C 915 nt5.39□□□□□ -1.55
GDT1P38301 MET31YPL038W 534 nt5.39□□□□□ -1.55
GDT1P38301 MNS1YJR131W 1650 nt5.39□□□□□ -1.55
GDT1P38301 PCA1YBR295W 3651 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 ERD1YDR414C 1089 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 EAF5YEL018W 840 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 GRX4YER174C 735 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 NPY1YGL067W 1155 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 SKI6YGR195W 741 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 AIM20YIL158W 615 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 PRP45YAL032C 1140 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 YML018CYML018C 1182 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 CDC28YBR160W 897 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 NDC1YML031W 1968 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 YOR1YGR281W 4434 nt5.38□□□□□ -1.55
GDT1P38301 GPR1YDL035C 2886 nt5.37□□□□□ -1.55
GDT1P38301 SIT4YDL047W 936 nt5.37□□□□□ -1.55
GDT1P38301 YDR154CYDR154C 351 nt5.37□□□□□ -1.55
GDT1P38301 RTT103YDR289C 1230 nt5.37□□□□□ -1.55
GDT1P38301 UTR4YEL038W 684 nt5.37□□□□□ -1.55
GDT1P38301 SPL2YHR136C 447 nt5.37□□□□□ -1.55
GDT1P38301 MIM2YLR099W-A 264 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms