Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM23P36406 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM23P36406 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM23P36406 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms