Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN2P35609 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN2P35609 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms