Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT9P35527 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT9P35527 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT9P35527 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT9P35527 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT9P35527 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT9P35527 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT9P35527 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT9P35527 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT9P35527 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT9P35527 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT9P35527 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT9P35527 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT9P35527 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT9P35527 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT9P35527 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT9P35527 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT9P35527 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT9P35527 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT9P35527 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT9P35527 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT9P35527 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT9P35527 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT9P35527 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT9P35527 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT9P35527 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT9P35527 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT9P35527 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT9P35527 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT9P35527 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT9P35527 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT9P35527 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT9P35527 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT9P35527 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT9P35527 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT9P35527 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT9P35527 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT9P35527 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT9P35527 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT9P35527 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT9P35527 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT9P35527 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT9P35527 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT9P35527 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT9P35527 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT9P35527 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT9P35527 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms