Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCGF2P35227 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF2P35227 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms