Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPS1P31327 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPS1P31327 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPS1P31327 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPS1P31327 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPS1P31327 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPS1P31327 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPS1P31327 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPS1P31327 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CPS1P31327 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPS1P31327 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPS1P31327 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPS1P31327 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPS1P31327 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CPS1P31327 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CPS1P31327 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CPS1P31327 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CPS1P31327 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPS1P31327 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPS1P31327 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CPS1P31327 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CPS1P31327 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CPS1P31327 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CPS1P31327 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CPS1P31327 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPS1P31327 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPS1P31327 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPS1P31327 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPS1P31327 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CPS1P31327 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CPS1P31327 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CPS1P31327 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CPS1P31327 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CPS1P31327 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CPS1P31327 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CPS1P31327 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CPS1P31327 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CPS1P31327 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPS1P31327 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPS1P31327 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPS1P31327 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CPS1P31327 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPS1P31327 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPS1P31327 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CPS1P31327 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CPS1P31327 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CPS1P31327 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms