Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC13P31276 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC13P31276 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms