Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXA13P31271 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA13P31271 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA13P31271 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms