Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRB3P28472 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRB3P28472 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB3P28472 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms