Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX2P28328 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX2P28328 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX2P28328 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX2P28328 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX2P28328 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX2P28328 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX2P28328 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX2P28328 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX2P28328 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX2P28328 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX2P28328 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX2P28328 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX2P28328 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX2P28328 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX2P28328 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX2P28328 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX2P28328 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX2P28328 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX2P28328 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX2P28328 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX2P28328 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX2P28328 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX2P28328 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX2P28328 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX2P28328 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX2P28328 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX2P28328 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX2P28328 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX2P28328 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PEX2P28328 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms