Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMOD1P28289 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMOD1P28289 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD1P28289 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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