Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IVDP26440 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IVDP26440 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IVDP26440 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IVDP26440 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IVDP26440 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IVDP26440 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IVDP26440 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IVDP26440 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IVDP26440 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IVDP26440 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IVDP26440 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IVDP26440 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IVDP26440 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IVDP26440 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IVDP26440 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IVDP26440 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IVDP26440 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IVDP26440 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IVDP26440 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IVDP26440 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IVDP26440 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IVDP26440 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IVDP26440 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IVDP26440 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IVDP26440 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IVDP26440 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IVDP26440 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IVDP26440 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IVDP26440 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IVDP26440 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms