Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
DNMT1P26358 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DNMT1P26358 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
DNMT1P26358 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
DNMT1P26358 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms