Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA3P25788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA3P25788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA3P25788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms