Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPH2P23942 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPH2P23942 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms