Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2B4P23634 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B4P23634 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms