Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCEA1P23193 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA1P23193 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms