Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF3P20783 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF3P20783 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF3P20783 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF3P20783 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF3P20783 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF3P20783 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF3P20783 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF3P20783 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF3P20783 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF3P20783 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTF3P20783 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTF3P20783 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTF3P20783 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTF3P20783 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTF3P20783 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTF3P20783 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTF3P20783 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTF3P20783 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NTF3P20783 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NTF3P20783 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms