Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms