Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCLP19338 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCLP19338 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCLP19338 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCLP19338 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCLP19338 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCLP19338 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCLP19338 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCLP19338 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCLP19338 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCLP19338 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCLP19338 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCLP19338 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCLP19338 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NCLP19338 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCLP19338 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCLP19338 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCLP19338 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCLP19338 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCLP19338 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCLP19338 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCLP19338 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCLP19338 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCLP19338 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCLP19338 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCLP19338 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCLP19338 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCLP19338 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NCLP19338 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCLP19338 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCLP19338 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCLP19338 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCLP19338 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCLP19338 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCLP19338 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCLP19338 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCLP19338 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCLP19338 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCLP19338 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCLP19338 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCLP19338 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NCLP19338 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCLP19338 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms