Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF6P18850 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6P18850 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6P18850 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6P18850 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6P18850 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6P18850 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6P18850 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6P18850 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6P18850 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6P18850 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6P18850 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6P18850 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6P18850 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6P18850 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6P18850 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF6P18850 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF6P18850 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF6P18850 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF6P18850 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF6P18850 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF6P18850 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF6P18850 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6P18850 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF6P18850 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF6P18850 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF6P18850 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF6P18850 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF6P18850 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF6P18850 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6P18850 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6P18850 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6P18850 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6P18850 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6P18850 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6P18850 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6P18850 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms