Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHCEP18577 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHCEP18577 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHCEP18577 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHCEP18577 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHCEP18577 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHCEP18577 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHCEP18577 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHCEP18577 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHCEP18577 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHCEP18577 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHCEP18577 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHCEP18577 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHCEP18577 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHCEP18577 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHCEP18577 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHCEP18577 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHCEP18577 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHCEP18577 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHCEP18577 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHCEP18577 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHCEP18577 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHCEP18577 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHCEP18577 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHCEP18577 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHCEP18577 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHCEP18577 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHCEP18577 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHCEP18577 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHCEP18577 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHCEP18577 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHCEP18577 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHCEP18577 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHCEP18577 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHCEP18577 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHCEP18577 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHCEP18577 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHCEP18577 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RHCEP18577 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms