Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB5P18084 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGB5P18084 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB5P18084 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms