Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB1P14653 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB1P14653 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB1P14653 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms