Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRIM27P14373 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM27P14373 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms