Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2F2P13984 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2F2P13984 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms