Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL5P13501 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL5P13501 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL5P13501 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL5P13501 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL5P13501 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL5P13501 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL5P13501 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL5P13501 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL5P13501 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL5P13501 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL5P13501 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL5P13501 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL5P13501 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL5P13501 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL5P13501 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL5P13501 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL5P13501 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL5P13501 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL5P13501 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL5P13501 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL5P13501 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL5P13501 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL5P13501 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL5P13501 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL5P13501 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL5P13501 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL5P13501 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL5P13501 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL5P13501 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL5P13501 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL5P13501 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL5P13501 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL5P13501 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL5P13501 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCL5P13501 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCL5P13501 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL5P13501 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL5P13501 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL5P13501 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL5P13501 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL5P13501 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL5P13501 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL5P13501 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL5P13501 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms