Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTN1P12814 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms