Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL6A2P12110 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms