Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX6A1P12074 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX6A1P12074 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX6A1P12074 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms