Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MS4A1P11836 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MS4A1P11836 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MS4A1P11836 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms