Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF1P10914 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF1P10914 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF1P10914 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF1P10914 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF1P10914 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF1P10914 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF1P10914 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF1P10914 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF1P10914 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF1P10914 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF1P10914 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF1P10914 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF1P10914 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF1P10914 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF1P10914 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF1P10914 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF1P10914 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms