Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RGPD2P0DJD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RGPD2P0DJD1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RGPD2P0DJD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms