Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2BP0DI82 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms