Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC4LP0CB38 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC4LP0CB38 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms