Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXB7P09629 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXB7P09629 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXB7P09629 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
HOXB7P09629 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HOXB7P09629 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXB7P09629 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXB7P09629 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms