Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT7P08729 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT7P08729 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT7P08729 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT7P08729 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT7P08729 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT7P08729 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT7P08729 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT7P08729 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT7P08729 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT7P08729 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT7P08729 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT7P08729 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT7P08729 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT7P08729 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT7P08729 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT7P08729 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT7P08729 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT7P08729 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT7P08729 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT7P08729 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT7P08729 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT7P08729 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT7P08729 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT7P08729 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT7P08729 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT7P08729 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT7P08729 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT7P08729 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT7P08729 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT7P08729 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT7P08729 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT7P08729 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT7P08729 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT7P08729 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT7P08729 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT7P08729 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT7P08729 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT7P08729 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT7P08729 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT7P08729 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT7P08729 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT7P08729 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT7P08729 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT7P08729 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT7P08729 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms